Çeşitli biyolojik materyallerde (bitkiler, mayalar, hayvan hücreleri, kök hücreler vb.) ve klinik örneklerde proteomik analizler (1D-, 2D-Elektroforez ve MS analizleri) yapılmaktadır. Protein ve peptidlerin [özellikle ısı şoku proteinleri (HSP'ler), allerjenik polen proteinleri, süt proteinleri ve hidroliz ürünlerinin] biyoaktiviteleri belirlenmekte, elektroforetik/kromatografik ayırımı ve Western-blot analizleri gerçekleştirilmektedir. Süperoksitdismutaz (SOD), katalaz, peroksidaz, inozin monofosfat dehidrogenaz (IMPDH), kaspazlar gibi çeşitli enzimlerin aktiviteleri ölçülmektedir. Genetik mühendisliği teknikleriyle geliştirilen rekombinant hücrelerde ve klinik örneklerde oksidatif stres ve apoptoz ile ilişkili genlerin ekspresyonu incelenmekte ve protein profilleri karşılaştırılmaktadır.
Birimdeki protein çalışmaları, 1990 yılında bitkisel laktat dehidrogenaz (LDH) ve peroksidaz enzimlerinin elektroforetik analizi ve enzim aktivitesi tayinleriyle başlamıştır. Protein analiz laboratuvarı, 2004 yılından itibaren BAP ve TÜBİTAK destekli projelerle alt yapısı güçlendirilmiş, sofistike cihazlarla donatılmış modern bir proteomik laboratuvarına dönüştürülmüştür.
Proteomik laboratuvarının amacı, moleküler biyolojinin önemli kısımlarından birini oluşturan protein çalışmalarında uluslararası standartlarda sofistike cihazlar ve yeni yöntemler kullanarak, nitelikli ve kapsamlı bilimsel araştırmalar yapmaktır. Ayrıca, uzman kişilerin yetiştirilmesi ve bu alanda bir referans laboratuvar haline dönüşmek amaçlanmaktadır. MS çalışmaları çeşitli ulusal ve uluslararası işbirlikleriyle desteklenmektedir.
Proteomic analyses (1D-,
2D-electrophoresis ans MS analysis) are being conducted on various biological
materials (plants, yeasts, animal cells, stem cells etc.) and on clinical samples.
Bioactivities of protein and peptides [especially heat shock proteins (HSPs), allergenic pollen
proteins, milk proteins and hydrolysis products) are determined, and electrophoretic/chromatographic separations techniques and Western blotting analyses are
carried out. Activities of various enzymes such as superoxide dismutase (SOD), catalase, peroxidase, inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH) and
caspases are measured. The expression of oxidative stress- and apoptosis-related
genes are examined in recombinant cells developed by genetic engineering
techniques and in clinical samples, and also protein profiles are compared.
Cihaz Adı : Mikropipet (0.1, 20, 100, 200 µl ve üçlü set) Marka : CAPP Model : BELİRTİLMEMİŞ Teknik Özellik : BELİRTİLMEMİŞ Miktar : 5 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : 3’lü Mikropipet (20 µl, 200 µl, 1000 µl) Marka : Gilson Model : Neo Starter Kit (P20+P200N+P1000N) Teknik Özellik : BELİRTİLMEMİŞ Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : İnteraktif Kesintisiz Güç Kaynağı Marka : Lıne Model : BELİRTİLMEMİŞ Teknik Özellik : Güç Kaynağı Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Liyofilizatör Marka : Christ plus Model : alpha 1 4 ld Teknik Özellik : Toplam buz tutma kapasitesi 2,5 kg, Minimum kondenser sıcaklığı –55°C. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Evaporotör Marka : Heidolph Model : BELİRTİLMEMİŞ Teknik Özellik : Manuel ve motorlu asansör arasında seçim sunar. İntegre vakum kontrolü ve otomatik distilasyon için kullanılan tüm programları kontrol edebileceğiniz 4.3” renkli grafik ekrana sahiptir. Miktar : 2 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : PX1 PCR Plate Sealer Marka : Bio-Rad Model : PX1 PCR Teknik Özellik : PX1 PCR plaka kapatıcısı, damlacıklı PCR cihazına ait bir parça olup tüm mikroplaka boyunca sızdırmazlık özelliği sağlamaktadır. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Microrotofor Marka : Biorad Model : MicroRotofor Teknik Özellik : MicroRotofor hücresi, küçük hacimlerde (2.5 mi) proteinleri pI'leri tarafından serbest çözeltide parçalamak için sıvı faz IEF kullanır. MicroRotofor hücresi, herhangi bir protein analiz tekniğinden (kütle spektrometrisi ve 2-D elektroforezi dahil) önce numunelerin karmaşıklığını azaltmak için kullanılabilir. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Elektroforez sistemi Marka : Biorad Model : Mini-PROTEAN® Teknik Özellik : Çok yönlü, kullanımı kolay Mini-PROTEAN Tetra Hücresi hızlı, basit kurulum için tasarlanmış, hızlı numune optimizasyonu, yöntem geliştirme ve hedeflenen protein analizini kolaylaştıran dikey bir mini jel elektroforez sistemidir. Miktar : 3 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Güç Kaynağı Marka : Biorad Model : PowerPac™ Basic Teknik Özellik : Yatay ve mini dikey jel elektroforezi gibi temel uygulamalar için kullanılır. Çıkış aralığı (programlanabilir) 10–300 V, 1 V adımlarla tamamen ayarlanabilir 4–400 mA, 1 mA adımlarla tamamen ayarlanabilir 75 W (maksimum) Miktar : 3 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Qubit Fluorometre Marka : İnvitrogen Model : Q32857 Teknik Özellik : DNA, RNA ve proteinin miktarının belirlenmesi için kullanılmaktadır. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer |
Cihaz Adı : Protean Plus Dodeca Cell Elektroforez Sistemi Marka : BioRad Model : BELİRTİLMEMİŞ Teknik Özellik : 12 büyük jelin aynı anda yürütülebildiği elektroforez sistemi. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Spektroflorometre Marka : BioTek Model : FLx800 Teknik Özellik : Floresans ve luminesans okuma yapabilen cihazın üzerinde 2 eksitasyon (300?650 nm), 2 emisyon (340?800 nm) filtresi bulunmaktadır. 6, 24, 48, 96, 384 kuyucuklu kaplarda, ayrıca PCR tüp ve kaplarında okuma yapabilmektedir. Cihazın 500C?a kadar ısıtma özelliği bulunmaktadır. Endpoint okuma, kinetik okuma ve kuru tarama yapabilmektedir. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Densitometre Marka : BioRad Model : GS-800 Teknik Özellik : 1-D ve 2-D Protein jellerinin analizini gerçekleştirmektedir. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : TÜBİTAK |
Cihaz Adı : Otoklav Marka : Nüve Model : OT 012 Teknik Özellik : Kapasite: 12 litre, Sıcaklık çalışma aralığı: 110°C / 140°C Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer |
Cihaz Adı : Ultrasaf su cihazı Marka : MILLIPORE Model : BELİRTİLMEMİŞ Teknik Özellik : doğrudan çeşme suyu beslemeli ultra saf ve saf su üretimi için kompakt su sistemleri sağlamaktadır Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Mini Buz dolabı(-20) Marka : Hotpoint Ariston Model : BELİRTİLMEMİŞ Teknik Özellik : BELİRTİLMEMİŞ Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer |
Cihaz Adı : Derin Dondurucu (-20) Marka : Arçelik Model : belirtilmemiş Teknik Özellik : belirtilmemiş Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer |
Cihaz Adı : Buz dolabı(+4) Marka : Vestel Model : belirtilmemiş Teknik Özellik : belirtilmemiş Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Pipet Seti Marka : Eppendorf Research® plus Model : belirtilmemiş Teknik Özellik : : Son derece hafif Pisronlu pipetlemenin yenilikçi, yeniden tasarlanmış prensibi, harika kimyasal, termal ve mekanik direnci olan Fortron®'dan yapılmış piston En düşük aspire, dağıtma, havaya uçurma ve uç çıkarma kuvvetleri Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Çalkalayıcı Marka : Heidolph Model : Unimax Teknik Özellik : Çalkalayıcı, hareket için 32 mm strok uzunluğu sunar. Sürekli ayar ile 30 ila 250 RPM arasında değişken hız. Sesli alarm ve otomatik durdurma ile 1 ila 999 dakika arasında zamanlayıcı Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : TÜBİTAK |
Cihaz Adı : Vorteks Marka : Velp Scientifica Model : ZXClassic Teknik Özellik : 3000 rpm'ye kadar ayarlanıp elektronik olarak kontrol edilen değişken hızda karıştırma yapar. Tüp destek yuvası üzerine bastırıldığında karıştırma otomatik başlar Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Ultrasonik Su banyosu Marka : WıseClean Model : belirtilmemiştir Teknik Özellik : Mikroişlemci Kontrolü: Zamanlayıcı, Sıcaklık ve Çıkış Kontrolü. Çok Frekanslı Sonikasyon Gövdesi. HF Frekansı: 40 kHz Ortam Sıcaklığı ile 80 Range arası Sıcaklık Aralığı Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Mikrosantrifüj Marka : WıseSpin Model : CF-10 Teknik Özellik : : Max. RPM 13,500 RPM Max. RCF 12,225 x g Max. Kapasite: 1.5ml (2.0ml)×12 Tüp Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : ROTATÖR Marka : ISOLAB Model : belirtilmedi Teknik Özellik : 4 kilogram ağırlığa kadar yumuşak fakat çok etkin çalkalamalı karıştırma olanağı sağlar. Her turda silindirler kendi eksenleri etrafında tam bir dairesel tur atarlar. Miktar : 2 Cihaz Kaynağı : Diğer |
Cihaz Adı : Isıtıcı Blok Marka : WiseTherm Model : HB-48P Teknik Özellik : belirtilmedi Miktar : 2 Cihaz Kaynağı : BAP |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Tip | Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|---|
Proje (BAP) | Bitkisel Biyoaktif Bileşiklere Ait Kütle Spektrumlarının Güncel Veri Tabanlarında (Ms Kütüphanelerinde) Taranması | Proje No: FBA2016-21062 (devam ediyor) | Nazlı Arda, Hesna Yiğit, Evren Önay Uçar , Murat Pekmez |
Proje (BAP) | Microcystis Aeruginosa Toksik Peptidlerinin Kromatografik Analizi Ve Epitel Hücreleri Üzerindeki Etkilerinin Değerlendirilmesi | Proje No: FYL2016-21655 (devam ediyor) | Nazlı Arda, Seda Kuşoğlu |
Proje (BAP) | Tenacibaculum Maritimum İzolatlarının Filogenetik ve Enzimatik Karaterlerinin İncelenmesi | Proje No: FBA2016-21250 (devam ediyor) | Terje Steinum, Süheyla Karataş, Emine Şeküre Nazlı Arda, Remziye Eda Yardımcı, Murat Pekmez, Emre Turgay, Fatma Tekeli |
Proje (BAP) | Preeklampside Anjiyogenez Faktörleri İle Plazma Proteomu Arasındaki İlişkinin Değerlendirilmesi | Proje No: FDK2016-22922 (devam ediyor) | Nazlı Arda , Vildan Yaman |
Proje (BAP) | Polen Alerjeni Metiyonin Sentazın Biyoteknolojik Üretimi Üzerine Çalışmalar | Proje No: 57936 (tamamlandı) | Nazlı Arda,Yunus Aksüt |
Proje (BAP) | Sakarya İlinde Bulunan Gökkuşağı Alabalığı İşletmelerinde Ortaya Çıkan Bakteriyel Hastalıkların Karakterizasyonu ve Teşhisi | Proje No: 35964 (tamamlandı) | Süheyla Karataş Steinum, Emre Turgay, Remziye Eda Yardımcı, Nazlı Arda |
Proje (BAP) | Bazı Bitki Ekstrelerinin Antioksidan Aktivitesi ve Rozmarinik Asit İçeriği Üzerine Çalışmalar | Proje No: 58297 (tamamlandı) | Nazlı Arda, Omar Said |
Proje (BAP) | Gıda Endüstrisinde Peynir Altı Suyu Tozundan Biyoaktif Peptidlerin İzolasyonu | Proje No: 47818 (tamamlandı) | Nazlı Arda |
Proje (BAP) | Çeşitli Kanser Hücreleri Üzerinde Sitotoksik Etkili Paladyum Türevlerinin Moleküler Etki Mekanizmalarının Aydınlatılması | Proje No: 36696 (tamamlandı) | Nazlı Arda, Ömer Kaçar |
Proje (BAP) | Viscum album ekstrelerinin hücre kültürleri üzerindeki sitotoksik etkileri | Proje No: 27484 (tamamlandı) | Evren Önay Uçar |
Proje (BAP) | Antioxidant Activity of Whey and Whey Hydrolysates | Proje No: 3724 (tamamlandı) | Nazlı Arda |
Proje (BAP) | Antioxidant activity of whey protein fractions isolated by gel exclusion chromatography and protease treatment | Proje No: 5100 (tamamlandı) | Nazlı Arda |
Proje (BAP) | Protective effects of olive oil phenolics and gallic acid on hydrogene peroxide-induced apoptosis | Proje No: 24217 (tmamlandı) | Nazlı Arda |
Proje (BAP) | Triterpen Glikozit Scoposide C'nin Schizosaccharomyces'de IMPDH Üzerine İnhibe Edici Etkisi | Proje No: 33147 (tamamlandı) | Nazlı Arda |
Proje (TÜBİTAK) | Bazı Bitkilerin Anti-bakteriyel ve Anti-viral Aktivitelerinin Araştırılması | Proje No: 113Z056 (devam ediyor) | Hesna Yiğit, Nazlı Arda, Evren Önay Uçar, Kadir Turan |
Proje (BAP) | İndometasin ve E Vitamini Uygulanmış C6 Sıçan Glioma Hücrelerinde Ölüm Mekanizmalarının Araştırılması | Normal Kapsamlı Proje No: 33503 (tamamlandı) | Murat Pekmez, Nazlı Arda |
Proje (BAP) | Moleküler Biyoteknoloji Laboratuvarının Kurulması | ÖNAP Projesi, Proje no: 29681 (tamamlandı) | Nazlı Arda, Nermin Gözükırmızı, Şule Arı, Ayşe Filiz Gürel, Ali Karagöz, Gülruh Albayrak, Ercan Arıcan, Bedia Palabıyık, Tuba Günel, Semian Karaer, Neslihan Turgut Kara, Evren Önay Uçar, Çağatay Tarhan, Murat Pekmez, Özgür çakır, Aslıhan Temel, Cüneyt Uçarlı, Sevgi Maraklı |
Proje (BAP) | Endokrin Bozucu Kimyasalların Toksisitelerinde Epigenetik Mekanizmaların Rolü | ÖNAP Projesi, Proje no: 37505 (tamamlandı) | Sibel Özden, Evren Önay Uçar |
Proje (BAP) | Schizosaccharomyces pombe'de hücre içi fosforilasyonun gösterilmesi | ACİP Proje No: 20423 (tamamlandı) | Bedia Palabıyık, Evren Önay Uçar |
Proje (BAP) | Glukotoksisite, Lipotoksisite ve Glukolipotoksisite Durumlarında Pankreatik Kök Hücreler, Asinar Hücreler ve Pankreatik Kanal Hücrelerinin Beta Hücrelerine Farklılaşma Mekanizmalarının Araştırılması | Proje No: 25275 (tamamlandı) | Şehnaz Bolkent, Nazlı Arda, Selda Gezginci Oktayoğlu, Evren Önay Uçar, Serap Sancar Baş, Ayşe Karatuğ |
Proje (BAP) | Sanicula europaea Ekstresinin Hücre Kültüründe Oksidatif Stres Sonucu Oluşan Hasarların Onarımı Üzerine Etkileri | Proje No: 22649 (tamamlandı) | Evren ÖNAY UÇAR, Nazlı Arda |
Proje (BAP) | Oksidatif Protein Hasarlarının Belirlenmesinde ve Antioksidan Aktivite Tayininde Proteomik Yaklaşım | Proje No: 4120 (tamamlandı) | Nazlı Arda, Ali Karagöz, Evren Önay Uçar, Avni Kuru, Murat Pekmez |
Proje (BAP) | İstanbul Park, Bahçe ve Korularındaki Bazı Ağaç Polenlerinin Alerjenitesinin ve İmmunohistokimyasal Özelliklerinin Araştırılması | Proje No: 3063 (tamamlandı) | Suna Büyüköztürk, Nazlı Arda, Aslı Gelincik, Günnur Deniz, Gaye Erten, Nurgül Karlıoğlu, Evren Önay Uçar, Murat Pekmez |
Proje (BAP) | Hücre Kültüründe Oksidatif Stres Sonucu Oluşan DNA Hasarı/Onarımı Üzerine Viscum album Ekstresinin Etkileri | Proje No: 1462 (tamamlandı) | Ali Karagöz, Nazlı Arda, Özlem Erol, Evren Önay Uçar, Murat Pekmez |
Proje (BAP) | Hücre Kültürlerinde Oksidatif Stres Sonucu Oluşan Protein Karbonillerinin Fluorometrik ve Elektroforetik Analizi | Proje No: 268/23082004 (tamamlandı) | Nazlı Arda, Murat Pekmez, Evren Önay İsmail Hamad, Özlem Erol |