Bitki patoloji laboratuvarında, Türkiye ve İran?ın farklı coğrafik bölgelerinde arpa, buğday ve mısır bitkilerinde başak yanıklığı ve kök boğazı çürükçülü hastalığı oluşturan Fusarium cinsine ait 70?in üzerinde izolat ile çalışmalar gerçekleştirilmektedir. Çalışmalar fungal patojenlerin alem, cins ve tür düzeylerinde tanılarını, moleküler markır teknikleri ile genetik çeşitliliklerinin araştırılmasını, kemotiplerinin belirlenmesini, sekonder metabolit ve gen anlatım profillerinin belirlenmesini, profillerinin belirlenmesini ve genetik mühendisliği uygulamaları ile transformasyonlarını içermektedir.
Fusarium türlerinin tanısı moleküler markırlar aracılığıyla
gerçekleştirilmektedir. Ayrıca RAPD, CAPS, PZR-RFLP, SCAR, ISSR, SSR moleküler
markır teknikleri kullanılarak izolatların (kromozomal ve mitokondriyal)
genotiplendirme çalışmaları sürdürülmektedir. Özgün DNA dizilim bilgileri NCBI
veritabanına kayıt ettirilerek aksesyon numaraları alınmaktadır.
Mantarlarda kemotiplendirme çalışmaları kapsamında; mantarların mikotoksin üretme potansiyelleri genomik (PZR temelli) ve transkriptomik düzeyde (RT-PZR ve Gerçek zamanlı-PZR) analiz edilmektedir. Üretilen mikotoksinlerin varlığı ise ince tabaka kromatografisi analizi ile tayin edilmektedir. Pigmentasyondan sorumlu farklı sekonder metabolitlerin analizi de PZR, RT-PZR, Gerçek zamanlı-PZR ve ince tabaka kromatografisi uygulamaları ile yapılmaktadır.
Fusarium türlerinde gen susturma (quelling) çalışmaları
kapsamında, toksin üretimiyle ilişkili genlere özgün sentetik siRNA molekülleri
tasarlanmaktadır. Ayrıca bu genlerin kopyalarını taşıyan susturma vektörleri
geliştirilmektedir. Fusarium türlerinde
genetik manipülasyonlar birlikte-transformasyon düzeyinde gerçekleştirilmektedir.
Transformantlar; morfolojik, genomik, transkriptomik, metabolomik,
spektrofluorimetrik düzeylerde incelenmektedir.
In plant pathology laboratory, studies on more than 70
isolates belonging to Fusarium genus
which causes head blight and root rot diseases on maize, wheat and barley in
different geographic regions of Turkey and Iran have been carried out. Researches include identification of
fungal pathogens at kingdom, genus and species levels, and investigation of
genetic diversity via molecular marker techniques, chemotype determination,
revealing secondary metabolite and gene expression profiles and transformation
by genetic engineering approaches.
Diagnosis of Fusarium species has been carried out by molecular markers. Besides, genotyping of isolates is maintained by molecular marker techniques such as RAPD, CAPS, PCR-RFLP, SCAR, ISSR, SSR. Accession numbers has been gained by depositing specific DNA sequence information to NCBI database.
Within the context of chemotyping studies in fungi; potential to produce mycotoxin by fungus is analysed at genomic (PCR based) and transcriptomics (RT-PCR and Real time PCR) levels. Presence of produced mycotoxins is determined by thin layer chromatography. Analysis of different secondary metabolites responsible for pigmentation is also carried out by PCR, RT-PCR, real time PCR and thin layer chromatography.
Within quelling studies in Fusarium species, synthetic siRNA molecules specific to genes
associated with mycotoxin production are designed. Moreover, silencing vectors
have copies of these genes are being developed. Genetic manipulations in Fusarium species are maintained by
co-transformation level. Transformants are investigated at morphological,
genomics, transcriptomics, metabolomics and spectrofluorimetic levels.
Cihaz Adı : Bitki büyütme kabini Marka : Daihan Model : WGC 450 Teknik Özellik : in vitro kültür başlatılması, devam ettirilmesini sağlayan, belirli sıcaklıklar ve nemde çalışan büyütme kabini Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Çalkalamalı etüv Marka : IKA Model : KS 4000 Teknik Özellik : in vitro kültür başlatılması, devam ettirilmesini sağlayan, belirli sıcaklıklarda ve hızda çalışan çalkalayıcı Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Steril kabin Marka : Nüve Model : LN120 Teknik Özellik : Kültür çalışmalarında steril ortam sağlayan (UV filtresi içeren) laminar flow Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : Dijital Görüntüleme Sistemi Marka : Olympus Model : Yok Teknik Özellik : Eş zamanlı mikroskobik gözlem Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Cihaz Adı : PCR Cihazı Marka : Biorad Model : T100 Teknik Özellik : Polimeraz zincir reaksiyonu gerçekleştirebilme Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : BAP |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Tip | Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|---|
Proje (BAP) | Mikotoksin Üretme Potansiyelinin Fusarium Türlerinde PZR Analizi ile Belirlenmesi | İ.Ü. ", BAP Y.L. tez | Müyesser Kayiş, Gülruh Albayrak |
Proje (BAP) | Fusarium graminearum İzolatlarının CAPS Markırlarıyla Genotiplendirmesi | İ.Ü. BAP Y.L. tez, | Funda Kaya, Gülruh Albayrak |
Proje (BAP) | Fusarium graminearum İzolatlarının Mitokondriyal DNA Varyasyon Analizi | İ.Ü. BAP Y.L. tez, 43153 | Aylin Gazdağlı, Gülruh Albayrak |
Proje (BAP) | Fusarium culmorum İzolatlarının CAPS Markırlarıyla Genotiplendirmesi | İ.Ü. BAP Arastırma Projesi, 41643 | Özgür Çakır, Şule Arı |
Proje (BAP) | Fusarium Türlerinde Trikotesen Üretiminin Durdurulması | İ.Ü. BAP Doktora Projesi, 23489/11052012 | Gülruh Albayrak, Emre Yörük |
Proje (BAP) | Fusarium Türlerinin Genotiplendirilmesinde Kullanılabilecek Yeni Genik Mikrosatellit Markırlarının Geliştirilmesine Yönelik Çalışmalar | Bilimsel Araştırma Projesi No : 30698 | Gülruh Albayrak |
Proje (BAP) | Fusarium graminearum ve Fusarium culmorum izolatlarının ISSR markır temelli genetik tiplendirmesi | İ.Ü. BAP Arastırma Projesi, ÖNAP, 23672/11062012. | Gülruh Albayrak |
Proje (BAP) | Fusarium graminearum ve Fusarium culmorum türlerinin tanısında kullanılabilecek SCAR markırlarının araştırılmasına yönelik çalışmalar | İ.Ü. BAP Arastırma Projesi, YADOP, 5765/05032010 | Gülruh Albayrak |
Proje (BAP) | Fusarium graminearum ve Fusarium culmorum izolatlarının RAPD markırlarına dayalı genetik tiplendirmesi | İ.Ü. BAP No. BAP, Y.L. tez, 1494/04092007 | Gülruh Albayrak, Emre Yörük |