Tüberküloz Moleküler Epidemiyolojisi Laboratuvarı, öncelikli olarak İstanbul ve çevresinde tüberküloza neden olan suşların moleküler yöntemlerle (24-loci MIRU-VNTR typing ve spoligotyping) DNA parmakizlerini saptayarak bölgedeki bulaş dinamiklerini belirleme çalışmaları yapmaktadır. Moleküler epidemiyoloji yanında, moleküler mikobakteriyolojinin diğer konularında da araştırma çalışmaları devam etmektedir.ESAT6 ve CFP10 antijenleriyle uyarılmış tam kan örneklerinde IP10 düzeylerini belirleyerek latent TB tanısı yapan bir IG(P)RA testi Laboratuvarımızda geliştirilmiş olup, 3 yıldan uzun bir süredir rutin olarak kullanılmaktadır. Benzer şekilde, moleküler identifikasyon konusunda da araştırmalar sürmektedir. Bu çalışmalardan birinde, İtalyan ve İranlı çalışmacılarla birlikte yeni bir mikobakteri türü "Mycobacterium celeriflavum sp. nov" ilk olarak tanımlanmış ve isimlendirilmiştir.Laboratuvarımızda ayrıca iki yeni mikobakteri türü daha saptanmış olup ileri çalışmalar devam etmektedir. İlaçlara hızlı direnç (RIF, INH, OFX, vb) ve hızlı identifikasyonu aynı anda yapabilen kitlerin geliştirlmesi Laboratuvarımızın ilgi alanı içindedir. Bilimsel çalışmaların yanında, Laboratuvarımız İstanbul Verem Savaşı Derneği ve İstanbul Üniversitesi Rektörlüğü arasında 17 Şubat 2010 tarihinde imzalanan bir protokolle "İstanbul Verem Savaşı Derneği Üst Seviye Laboratuvarı" olarak hizmet vermekte ve bu şekilde tanı amaçlı hizmetleri de rutin olarak vermektedir.
Laboratuvarımızın Araştırma Altyapısı
Laboratuvarımız bilimsel araştırmaların ihtiyaç duyduğu çok farklı teknolojileri barındırmaktadır. Laboratuvarımızın değişik bölümlerinde, yayma incelemesinde kullanılan Işık/floresan mikroskobundan, DNA fragman analizi ve dizi analizinde kullanılan kapiller elektroforez ve dizi analizi cihazına kadar birçok teknik ekipman mevcuttur.
İşbirlikleri ve Projeler
Yeni mikobakteri türlerinin tanımlanması - Emerging Bacterial Pathogens Unit, San Raffaele Scientific Institute, Milano, Italya ile ortak çalışma, Pekin genotipi tüberküloz suşlarının ülkemizde saptanması ve bölge insan populasyonlarına adaptasyonu - Laboratory of Molecular Microbiology, St Petersburg Pasteur Institute, St Petersburg, Rusya, ile ortak çalışma, Mycobacterium caprae'ni genotipik çeşitliliği ve insanda oluşturduğu hastalığın özellikleri - AGES, Oesterreichische Agentur für Gesundheit und Ernaehrungssicherheit GmbH, Viyana, Avusturya ile ortak projeler yürütülmektedir.
The Tuberculosis Molecular Epidemiology Laboratory is primarily involved in the detection of transmission dynamics of tuberculosis in the city of Istanbul and its vicinity, by obtaining the DNA fingerprinting methods. Besides molecular epidemiology, researches on other issues of molecular mycobacteriology are going on as well. An IG(P)RA test based on the detection of IP10 levels in ESAT6- and CFP10-stimulated whole blood to diagnose latent TB has already been developed in our laboratory and in routine use for more than 3 years now. A brand-new species, Mycobacterium celeriflavum sp. nov is described together with Italian and Iranian collaborators in one of the research studies. Studies on developing new kits, which alleviate rapid detection of drug resistance (RIF, INH, OFX, etc) and rapid molecular identification are among the subject of interests of the laboratory. In addition to research activities, the laboratory has been assigned "the Upper Level Laboratory" of Istanbul Union Against Tuberculosis based on an agreement between Rectorate of Istanbul University and Istanbul Union Against Tuberculosis on February 17, 2010, thus is involved in diagnostic services on a routine-basis.
The Tuberculosis Molecular Epidemiology Laboratory is primarily involved in the detection of transmission dynamics of tuberculosis in the city of Istanbul and its vicinity, by obtaining the DNA fingerprints of Tuberculosis (TB) strains via molecular epidemiological typing methods (24-loci MIRU-VNTR typing, spoligotyping). Besides molecular epidemiology, research on other issues of molecular mycobacteriology are going on as well. An IG(P)RA test based on the detection of IP10 levels in ESAT6- and CFP10-stimulated whole blood to diagnose latent TB has already been developed in our laboratory and in routine use for more than 3 years now. A brand-new species, Mycobacterium celeriflavum sp. nov is described together with Italian and Iranian collaborators in one of the research studies. Studies on developing new kits, which alleviate rapid detection of drug resistance (RIF, INH, OFX, etc) and rapid molecular identification are among the subject of interests of the laboratory. In addition to research activities, the laboratory has been assigned "the Upper Level Laboratory" of Istanbul Union Against Tuberculosis based on an agreement between Rectorate of Istanbul University and Istanbul Union Against Tuberculosis on February 17, 2010, thus is involved in diagnostic services on a routine-basis.
Research Infrastructure of the Laboratory
The laboratory contains a broad spectrum of technologies to suit wide-ranging needs of scientific research. A vast number of technical equipments ranging from light / flourescent microscobes for smear microscopy up to capillary electrophoresis and sequencers for fragment analysis and sequencing are within the reach of the laboratory's separate divisions.
Collaborations and Projects
We have The description of new mycobacterial species -collaboration with Emerging Bacterial Pathogens Unit, San Raffaele Scientific Institute, Milan, Italy, The detection and adaptation of Beijing genotype TB strains to human populations in Turkey -collaboration with Laboratory of Molecular Microbiology, St Petersburg Pasteur Institute, St Petersburg, Russia, Genotypic diversity and characteristics of human disease caused by Mycobacterium caprae - collaboration with AGES, Oesterreichische Agentur für Gesundheit und Ernaehrungssicherheit GmbH, Wien, Austria projects being progressed at our laboratory.
Görev | Ünvan | Ad | Soyad | Dahili Telefon | AVES Link | |
---|---|---|---|---|---|---|
Müdür | DOÇENT | ORHAN KAYA | KÖKSALAN | 33345 | CV |
Cihaz Adı : MİKROSANTRİFÜJ Marka : BECKMAN COULTER Model : MICROFUGE 18 Teknik Özellik : Mikrotüplerin santrifüjlenmesi için Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : MİKROSANTRİFÜJ Marka : HERAEUS Model : BIOFUGE PICO Teknik Özellik : Mikrotüplerin santrifüjlenmesi için Miktar : 2 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : OTOKLAV Marka : H+P Model : VARIOKLAV 400E Teknik Özellik : Sterilizasyon için gerekli yüksek ısı ve basınç ortamını sağlar. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : EMNİYET KABİNİ Marka : KENDRA LABORATORY PRODUCTS Model : HERA SAFE Teknik Özellik : Örnek kontaminasyonunun engellenmesi ve personel güvenliğinin sağlanması için güvenli çalışma kabini Miktar : 2 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : HİBRİDİZASYON FIRINI Marka : BIOMETRA Model : OV 3 Teknik Özellik : Örneklerin hibridizasyonu için istenilen sıcaklığa ayarlanabilen homojenizasyonu sağlamak için çalkalama ve döndürme özellikleri bulunan etüv. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : ÇOK AMAÇLI OTOMATİK ÇALIŞMA İSTASYONU Marka : BECKMAN COULTER Model : BIOMEK NXP Teknik Özellik : Çoklu örneklerin çalışılmasında iş gücünü ve hata payını büyük ölçüde azaltmak için kullanılan otomatize sistem Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : MULTIPLEX SPOLIGO TİPLENDİRME Marka : LUMINEX Model : 200 Teknik Özellik : DNA parmakizi yöntemi olan spoligotyping cihazı Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : THERMAL GRADIENT CYCLER Marka : TECHNE Model : TC-5000 Teknik Özellik : Sıcaklık gradienti sağlayabilen PCR cihazı Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : THERMAL GRADIENT CYCLER Marka : BIOMETRA Model : T-GRADIENT Teknik Özellik : Sıcaklık gradienti sağlayabilen PCR cihazı Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : DERİN DONDURUCU -86C ULT Marka : THERMO SCIENTIFIC Model : FORMA 905 SERIES Teknik Özellik : -86C de örnekleri uzun süre bozulmadan saklamada kullanılır. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : DERİN DONDURUCU -86C ULC Marka : THERMO SCIENTIFIC Model : FORMA 923 SERIES Teknik Özellik : -86C de örnekleri uzun süre bozulmadan saklamada kullanılır. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : IŞIK MİKROSKOPU Marka : OLYMPUS Model : CH30 Teknik Özellik : 10X,40X,60X VE 100X BÜYÜTME Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Cihaz Adı : SOĞUTMALI SANTRİFÜJ Marka : EPPENDORF Model : CENTRIFUGE 5810 R Teknik Özellik : Çökrütülecek materyalin bozulmamasın için çöktürme işlemi sırasında sıcaklığı istenilen seviyede tutabilir. Miktar : 1 Cihaz Kaynağı : Diğer Alım Tarihi : 24/08/2014 |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|
No records found. |
Tip | Adı | Açıklama | Ekip |
---|---|---|---|
No records found. |