Research Laboratories Information System
Maya Genetiği, Teknolojisi ve Genomik Araştırmalar Laboratuvarı
Bu laboratuvarda bölünen maya olarak da bilinen Schizosaccharomyces pombe model olarak kullanılarak glukoz metabolizması, yaşlanma, ağır metal metabolizması, oksidatif stres ve pürin/pirimidin metabolizması gibi hücresel olaylar araştırılmaktadır.
Ascomycetes sınıfına ait maya tipi bir organizma olan Schizosaccharomyces pombe simetrik bölünme özelliği, hücre çevriminin belirgin olarak G1, S, G2 ve mitoz evrelerinden oluşması gibi özellikleriyle memeli hücrelerine benzemektedir.
Laboratuvarımızda ökaryotik hücrelerin çevrelerini nasıl algıladıkları ve buna yanıt olarak biyolojik süreçlerini nasıl düzenledikleri sorgulanmadtadır. Bu kapsamda, glukozun algılanması, hücre içine taşınması, sinyal iletimi, stres yanıt yolakları, depo karbonhidratlarının sentez ve yıkımı, tiamin ve purin metabolizması gibi metabolik yolaklar gen, genom ve biyokimyasal düzeylerde klasik maya genetiği yöntemleri ve moleküler tekniklerin birleştirilmesi ile araştırılmaktadır.
Kronolojik yaşlanma süreçlerinin hücresel metabolizma düzeylerinde araştırılması sürdürülmektedir.
Çeşitli genler bakımından S. pombe delesyonlu ırk kütüphanesi oluşturulmasına yönelik çalışmalar yürütülmektedir.
Ayrıca, çeşitli metabolik yolakların aydınlatılmasında, hayvansal ve bitkisel kaynaklı genlerin işlevlerinin belirlenmesi için heterolog gen anlatımı çalışmalarında konak olarak da kullanılmaktadır.
Düşük Basınç ünitesinde S.pombe'nin farklı basınç ve atmosfer şartlarında
verdiği hücresel cevaplar moleküler düzeyde incelenmektedir.
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, 34134 Vezneciler, İstanbul
Toplam kullanılan BAP Kaynağı: 277.000,00 TL
In this laboratuary, Schizosaccharomyces pombe is used as a model organism in the investigation of glucose metabolism, aging, heavy metal metabolism, oxidative stress and purine/pyrimidine metabolism.
Schizosaccharomyces
pombe is a very popular yeast as a
model organism in molecular biology studies and belongs to the Ascomycetes
family. Like mammalian cells, this organism has distinct G1, S, G2 and mitosis
phases and it is divided symmetrically.
In our lab. how
eukaryotic cells interact with environment and respond that stimulus has been investigated.
In this context, glucose sensing, import, signal transduction, stress response
pathways, tiamine and purin metabolisms has been investigated using the combination
of classical and modern genetic techniques.
The investigation of chronological aging processes is carried out at cellular metabolism level. The investigation of zinc chaperones spesific for the superoxide dismutase enzyme is also carried out. Studies on obtaining S. pombe deletion library is continued. Besides, for the determination of the function of some genes from plants and animals, S.pombe is used as a host.
In Low Pressure Unit, the cellular responses of S.pombe in different pressure and atmosphere conditions has been investigated at molecular level.
Istanbul University, Faculty of Science, Department of Molecular Biology and Genetics, 34134 Vezneciler, Istanbul, Turkey
Total resource (BAP): 277.000,00 TL
Cihaz Adı : Hücre Parçalıyıcı
Marka : Roche
Model : MagNA Lyser
Teknik Özellik : Hücre içeriğini açığa çıkarmak için memran parçalyıcı
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Hücre Parçalayıcı
Marka : Sartorius
Model : Mikrodismembrator-S
Teknik Özellik : Hücre içeriğini açığa çıkarmak için membran parçalayıcı cihaz.
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Bilgisayar Kontrollü Düşük Basınç Kabini
Marka : Nanovak
Model : -
Teknik Özellik : Düşük basınçlı ortam sağlayan bilgisayar kontrollü kabin.
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Mikromanipülatör Seti
Marka : Carl Zeiss
Model : -
Teknik Özellik : Tetrat ve spor analizinde kullanılan manipülatör cihazı.
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Real Time PCR
Marka : Roche
Model : LightCycler 480 System
Teknik Özellik : Gerçek zamanlı olarak gen anlatım düzeylerini ölçen ve karşılaştıran cihaz.
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Fermentör
Marka : Sartorius Stedium
Model : Biostat B plus
Teknik Özellik : Uzun süreli inkübasyon için fermentör.
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Hücre Sayım Cihazı
Marka : Inovatis
Model : Cedex HiRes
Teknik Özellik : Mayaya özgü canlı hücre sayımı yapabilen, boyut, kompaktlık, agregasyon gibi değerleri ölçebilen hücre sayım cihazı.
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Çalkalamalı Etüv
Marka : Sartorius Stedim
Model : Certomat IS
Teknik Özellik : Hücre üretimi için soğutmalı etüv
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAPCihaz Adı : Image Analyser
Marka : Kodak
Model : 4000 MM
Teknik Özellik : Jel görüntüleme ve analiz sistemi
Miktar : 1
Cihaz Kaynağı : BAP
- Makale & Yayın (13)
- Sanayi İşbirliği (0)
- Patent (0)
- Dış Kaynaklı Çalışma (0)
- Faydalı Model (0)
- Ticarileşme (0)
- Proje (5)
- Adı : Intracellular Scavenging Actiivity Of Trolox (6-Hydroxy-2,5,7,8-Tetramethylchromane-2-Caboxylic Acid9 In The Fission Yeast, Schizosacchoaromyces pombe
Açıklama : journal of Natural Science,Biology and AMERICAN JOURNAL OF MEDICINE, cilt.1, ss.16-21, 2010
Ekip : Karaer Uzuner S., Arda N., Temizkan G., Pekmez M., Hamad İ - Adı : An Addition To The Chromosome Map Of Schizosaccharomyces pombe The Localization Of Gua Genes
Açıklama : CURRENT GENETICS, vol.17, pp.543-545, 1990
Ekip : Oraler G., Olgun A., Karaer Uzuner S - Adı : The 3? Terminal Sequence Of Inosine Monophosphate Dehydrogenase Gene Encode An Active Domain In Schizosaccharomyces pombe
Açıklama : Genetics And Molecular Biology ", GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, vol.29, pp.551-557, 2006
Ekip : Karaer Uzuner S., Topal Sarıkaya A. , Arda N., Temizkan G - Adı : A Rapid Technique For The Determination Of Furfural In The Fission Yeast Culture Media
Açıklama : BIOTECHNOLOGY & BIOTECHNOLOGICAL EQUIPMENT, vol.14, pp.47-49, 2000
Ekip : Arda N., Topal Sarıkaya A., Palabiyik B., Temizkan G., Karaer Uzuner S. - Adı : Expression Of Plant ß-Glucosidase Genes In Schizosaccharomyces pombe
Açıklama : Biotechnology & Biotechnological Biotechnology Equipment, vol.20, pp.98-104, 2006
Ekip : Palabiyik B., Esen A., Albayrak G., Temizkan G., - Adı : Expression Of Human Cytochrome P450 3a4 Gene In Schizosaccharomyces pombe
Açıklama : Biologia, Bratislava, vol.63, pp.450-454, 2008
Ekip : Palabiyik B., Karaer Uzuner S., Arda N., Ertürk Toker S., Temizkan G., Kelly S., Topal Sarıkaya A - Adı : Genes Involved In Glucose Repression And Oxidative Stress Response In The Fission Yeast Schizosaccharomyces pombe
Açıklama : GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, vol.10, pp.4041-4047, 2011
Ekip : Süslü K.G., Palabiyik B., Temizkan G - Adı : Investigation Of The Relationship Between Oxidative Stress And Glucose Signaling In Schizosaccharomyces pombe
Açıklama : BIOCHEMICAL GENETICS, vol.50, pp.336-349, 2012
Ekip : Palabiyik B., Kığ C., Pekmez M., Dalyan L. , Arda N - Adı : Effects Of Glucose Sensing/Signaling On Oxidative Stress Response In Glucose Repression Mutants Of Schizosaccharomyces Pombe
Açıklama : GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, no.4, pp.5046-5056, 2013
Ekip : Palabiyik B., Jafari Ghods F., Uçar E - Adı : The Effect Of Superoxide Dismutase Deficiency On Zinc Toxicity In Schizosaccharomyces pombe
Açıklama : JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY, vol.47, pp.506-12, 2007
Ekip : Tarhan Ç., Pekmez M., Karaer Uzuner S., Arda E.Ş.N., Topal Sarikaya A. - Adı : Fission Yeast As A Model For Als Disease
Açıklama : JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, vol.131, pp.S-250, 2007
Ekip : Karaer Uzuner S., Tarhan Ç., Hamad İ., Pekmez M., Arda E.Ş.N., Topal Sarikaya A. - Adı : Expression Of Human A4v Mutant Cu,Zn Superoxide Dismutase In Schizosaccharomyces Pombe: Investigations Of Its Toxic Properties.
Açıklama : BIOCHEMICAL GENETICS, vol.1-2, pp.113-124, 2010
Ekip : Karer Uzuner S. , Tarhan Ç., Pekmez M., Hamad İ., Arda E.Ş.N., Topal Sarikaya A. - Adı : "Does Copper Stress Lead To Spindle Misposition-Dependent Cell Cycle Arrest?
Açıklama : GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, vol.11, pp.3824-34, 2012
Ekip : Tarhan Ç., Topal Sarikaya A
| Adı | Açıklama | Ekip |
|---|---|---|
| No records found. | ||
| Adı | Açıklama | Ekip |
|---|---|---|
| No records found. | ||
| Adı | Açıklama | Ekip |
|---|---|---|
| No records found. | ||
| Adı | Açıklama | Ekip |
|---|---|---|
| No records found. | ||
| Adı | Açıklama | Ekip |
|---|---|---|
| No records found. | ||
| Tip | Adı | Açıklama | Ekip |
|---|---|---|---|
| Proje (BAP) | Mayada Superoksit dismutaz enzimine özgü çinko taşıyıcı proteinlerin araştırılması" | No : 4117, Yönetici, 2013 | Çağatay TARHAN, Semian KARAER |
| Proje (BAP) | Schizosaccharomyces pombe'de hücresel yaşlanma üzerine çalışmalar | No : 18941, Yönetici, Devam eden proje | Çağatay TARHAN |
| Proje (BAP) | Shizosaccharomyces pombe?de gua1 Geninin Tam Delesyona Uğratarak Mutant Elde Edilmesi | No : 19601, Arastirmaci, 2013 | Bedia Gemici |
| Proje (BAP) | Schizosaccharomyces pombe invertaz mutantlarında glukoz sinyali ile oksidatif stres arasındaki ilişkinin genom boyutunda araştırılması | No : 14270, Yönetici, 2012 | Bedia Palabıyık |
| Proje (TÜBİTAK) | Schizosaccharomyces pombe'de Glukoz Baskılaması ve Stres Yanıt Yolaklarının Araştırılması | No : 211T178, Yönetici, 2013 | Bedia Palabıyık |
© 2019 İstanbul Üniversitesi
Bilgi İşlem Daire Başkanlığı